Comprehensive Respiratory Virus Kit

Superior Success Rate with Low Amounts of Clinical Sample

COVID-19 WGS with Celemics Comprehensive Respiratory Virus Kit

Overview

SARS-CoV-2 Phylogenetic Tree

※ Variants of Global Importance Highlighted In Bold.

Comprehensive Respiratory Virus Kit은 바이러스 전장유전체분석 및
바이러스 검출을 위한 키트로 SARS-CoV-2 돌연변이 및 변이체를 포함,
다양한 호흡기 질환 유발 바이러스를 분석할 수 있습니다.


바이러스는 보다 쉽게 감염되고 치료하기 어렵도록 지속적으로 진화하고 있습니다. 따라서 특정 질병을 유발하는 바이러스 균주의 발견과 특정 집단의 내에서의 확산력에 대한 연구는 공중 보건의 차원에서 매우 중요합니다.

Celemics Comprehensive Respiratory Virus Kit (CRV Kit)은 NCBI RefSeq 데이터베이스를 기반으로 인간의 호흡기 질환을 유발하는 바이러스를 검출, 시퀀싱하기 위해 개발되었습니다.

본 키트은 SARS-CoV-2의 모든 돌연변이 및 변이체의 전체 게놈 시퀀싱이 가능하며, 임상적으로 중요한 호흡기 질환을 유발하는 9 가지 다른 바이러스 유형의 39 개 균주를 동시에 검출할 수 있도록 설계되었습니다.

※ Global Distribution of SARS-CoV-2 Variants.

Performance

임상 검체에서 최고의 키트 성능 발휘

임상 검체를 이용한 CRV Kit 테스트 결과 매우 높은 Coverage를 보임을 확인하였습니다. 셀레믹스 고유의 시약, 프로브 최적화 과정을 포함한 Hybridization 기반의 target Enrichment 기술 덕택에 URT, NP/OP 등 미량의 임상 검체에서도 gap 발생을 최소화하여 높은 품질의 전장유전체 분석이 가능합니다. 특히 검체 상태에 따라 Amplicon 별 증폭 bias가 커 gap의 발생율이 높은 PCR 기반의 방식과 비교해 셀레믹스의 Target Enrichment기술은 Uniformity가 매우 높고 적은 양의 검체에서도 전장유전체 분석 성공률이 매우 높은 특징을 갖습니다.

Performance
Sample Type Coverage (1X) Coverage (10X) Coverage (100X)
Clinical specimen
( Illumina 2 X 75bp )
99.95% 99.87% 98.95%

※ Mutation Frequency and Genomic Structure of SARS-CoV-2 Variants.

Features &
Benefits

SARS-CoV-2 WGS 결과 제공
SARS-CoV-2의 모든 유전 변이 분석 가능
SARS-CoV-2 변이체 검출 가능
낮은 품질의 검체에서도 높은 WGS 성공률
낮은 품질의 임상 검체 및 환경 검체에서도 높은
바이러스 검출능을 갖춤
높은 바이러스 변이체 검출 및 WGS 성공률
염기 서열의 Gap 발생 빈도가 낮음
폭넓은 호흡기 바이러스를 타겟
9개 바이러스 종 (Type)의 39개 주 (Strain) 검출 가능
(SARS-CoV-2 단일 분석 가능)
임상적으로 중요한 호흡기 질환 바이러스 포함
한 번의 시험으로 중복 감염 탐지 가능
Stand-alone BI 분석 소프트웨어 제공
Stand-alone BI 분석 소프트웨어를 제공해드리므로
민감한 정보의 유출 방지 가능

Specification

“CRV Kit Specification”

Specification
Target Virus 9 Types / 39 Virus Strains, Including SARS-CoV-2
Mutation Analysis Variant Detection, Viral Mutation (SNV, Indel) From Generated Whole Genome Sequence
Sample Type URT, NP/OP, etc.
Platform All Illumina Sequencers
Kit Composition Provides all Required Reagents, Including RNA to cDNA kit, cDNA to Captured Library kit, and Bioinformatics SW
Bioinformatics Pipeline Stand-alone Bioinformatics SW ‘Celemics Virus Verifier’ ( FASTQ to Visual Report )

Pathogen list

“CRV Kit Pathogen list”

Pathogen list
Virus Strain
Coronavirus Coronavirus HKU1
Coronavirus NL63
Coronavirus 229E
Coronavirus OC43
SARS-CoV-2
Bocavirus 1/2/3/4/ (HBoV) Human Bocavirus 1
Human Bocavirus 2
Human Bocavirus 3
Human Bocavirus 4
Human Rhinovirus (A/B/C) Human Rhinovirus A
Human Rhinovirus B
Human Rhinovirus C
Human Adenovirus Human Adenovirus Type 1 (HAdV-C1)
Human Adenovirus Type 2 (HAdV-C2)
Human Adenovirus Type 3 (HAdV-B3)
Human Adenovirus Type 4 (HAdV-E4)
Human Adenovirus Type 5 (HAdV-C5)
Human Adenovirus 7 (HAdV-B7)
Human Adenovirus 14 (HAdV-B14)
Human Adenovirus 21 (HAdV-B21)
Pathogen list
Virus Strain
Human Enterovirus EV-C104
EV-C105
EV-C109
EV-C117
EV-C118
CV-A21
EV-D68
Influenza A Influenza A Virus (Flu A)
Influenza A-H1 Virus (Flu A-H1)
Influenza A-H3 Virus (Flu A-H3)
Influenza B Influenza B Virus (Flu B)
Parainfluenza Virus Parainfluenza 1 (PIV 1)
Parainfluenza 2 (PIV 2)
Parainfluenza 3 (PIV 3)
Parainfluenza 4 (PIV 4) A
Parainfluenza 4 (PIV 4) B
Respiratory Syncytial Virus Respiratory Syncytial Virus A (RSV A)
Respiratory Syncytial Virus B (RSV B)
Human Metapneumovirus
-

Stand-alone
SW

셀레믹스 자체 개발 BI 분석 소프트웨어를 통해 정확한 분석 결과 제공

※ 셀레믹스에서는 정확한 키트 데이터 분석을 위해 자체 개발한 BI 분석 소프트웨어를 제공해드립니다. 이를 통해 자세한 데이터 분석 및 민감 정보의 유출을 방지할 수 있습니다.

Workflow

01

RNA Extraction

02

NGS Iibrary Preparation

cDNA Synthesis, NGS Prep.

~5 Hours

03

Target Enrichment

Hybridization Capture

~ 4 Hours

04

Sequencing

Illumina Sequencer

Depending on Read Length

05

Data Analysis

Virus Data Report

~ 3 Hours

Preparation Kit를 포함한 포괄적인 키트 제공

  • 붉은 하이라이트 부분은 키트를 통해 제공되는 제품으로 수행 가능한 실험 영역입니다.
  • 경쟁사 대비 짧은 실험 시간 소요 (7시간 단축 / Target Enrichment 및 Hybridization Capture 과정)